原理生物洁净实验室不同于传统的一般无菌室。无菌室是一个相对密闭的实验室,其室内空气是静止的,没有动态的空气净化系统、换气系统和温湿度调控系统,虽然能在实验之前对实验室环境进行消毒灭菌,解决实验初始阶段的空气无菌度,但无法保证整个实验过程实验环境空气的洁净度和其他条件因素。
生物洁净实验室是应用空气洁净技术,由处理空气的空调净化设备、输送空气的管路系统和符合实验要求的洁净环境三大部分构成。首先,由送风口向室内送入洁净空气,室内的尘菌被洁净空气稀释后强迫其由回风口进入系统的回风管路,在空调设备的混合阶段和从室外引入的经过过滤处理的新风混合,再经过空调处理后又送入室内。室内空气如此反复循环,就可以在相当一个时期内把污染控制在一个稳定的水平上。
作为空气洁净技术主体的生物洁净实验室具有以下三大特点。(1)生物洁净室是空气的洁净度达到一定级别的可供人活动的空间,其功能是能控制微生物和各种微粒的污染。这表明洁净实验室的洁净不是一般的干净,而是达到了一定的空气洁净度级别；同时洁净室还必须具有控制微生物及微粒污染、抵抗外界干扰的能力,体现在有一个合理的满足实用的自净时间。(2)洁净室是一个多功能的综合整体,涉及多个专业,如:建筑、空调、净化、纯水、纯气等。(3)生物洁净实验室的技术要求涉及多个参数:空气洁净度、细菌浓度、空气的风量和风压、噪声、照度等。(4)为确保洁净室内的环境质量，从设计、施工、运行、维护以及各项管理的每个要素都起着重要的作用。也就是说洁净实验室本身也是通过从设计到管理的全过程来实现其净化质量的。