一般食品厂洁净车间可大致分为三个区域:一般作业区、准清洁区、清洁作业区。

1、一般作业区(非清洁区):一般的原料、成品、工具储存区域，包装成品转运区域等原料、成品裸露风险较低的区域，如外包装室、原辅料仓库、包装材料仓库、外包装车间、成品仓库等。

2、准清洁区:要求次之，如原料处理、包材处理、包装、缓冲间(拆包间)、一般生产加工间、非即食食品的内包装间等成品处理但不直接裸露的区域。

3、清洁作业区(洁净室):指卫生环境要求最高，人员、环境要求较高，必须经过消毒和更衣才可以进入，如:原料、成品裸露的处理区域，食食品的冷加工间、即食食品的冷却间、待包装即食食品的储存间、即食食品的内包装间等。食品厂不同生产区域和空气洁净度等级

为了使食品生产全过程不受微生物污染，要对原料、水、设备等进行处理，生产车间的环境是否洁净也是重要的一个条件。