洁净室空调参数要求较高，专业公司同样也进行二次深化设计，要求监理工程师具备施工过程质量控制要点：对进场材料设备的验收程序一定要严格把关。同时，总结出以下经验，也是洁净室工程公司常用的施工步骤与方法：
第一步，风管材质要符合设计要求，对原材脱脂工序坚持全检。
第二步，风管预制主要控制制作环境要符合，规定工艺是否符合设计。
第三步，安装过程的封闭控制以及法兰、紧固件要符合规范要求。
第四步，空调机组的试运转要脱开风管系统，漏风量测试。
第五步，洁净厂房壁板除检查平整度、垂直度外，主要控制密封状况，包括门窗的密封，水电气孔洞密封，以及表面清洁要使用无脱落纤维织物搽拭。
第六步，交叉施工，主要是自流坪施工，洁净厂房一定要防止施工过程产生的二次污染。自流坪地面施工，有对地坪打磨的工序，要使用自身带吸尘装置的打磨机。自流坪地面面层施工要掌握好时机，做早了交叉施工易造成损伤。尤其自地坪施工产生大量有害气体，无法排出，这时建议封闭回风口利用空调新风正压强制排气，新风口要另加装过滤器。
第七步，高效过滤器安装。安装前风管要先行吹扫，过滤器必须进行检漏试验，必要时全面检验，这是保证洁净度的关键工序。安装过程要符合规范要求。
第八步，洁净室工程施工过程中人员流动、工器具搬移和操作人员着装要实行严格管制。
第九步，洁净厂房地面平整度要求较高，洁净室地板施工也是一门非常有学问的工程。